Résumé des saisons:


 Chicago, de nos jours. Suite à un faux braquage, Michael Scofield (Wentworth Miller), un ingénieur en génie civil se fait délibéremment incarcéré au pénitencier d'Etat de Fox River[la prison]. Pourquoi ? Afin de se rapprocher de son frère, Lincoln Burrows (Dominic Purcell) lui-même incarcéré dans le couloir de la mort où il attend son exécution par chaise électrique après avoir été inculpé pour le meurtre de Terrence Steadman, personnage politique haut placé et industriel assez mystérieux.

Alors que Michael songe au destin de son frère et lui, Veronica Donovan (Robin Tunney), ancienne petite amie de Burrows et avocate réouvre le dossier de Lincoln et s'y penche. Pour Michael c'est une autre histoire car oui, Michael a un plan et ses petits secrets... Et pas des moindres : A Fox-River, pour survivre et se faire respecter il faut un plan et des alliés, même si ce doit être son pire ennemi.

Dans ce cas précisément, Lincoln et Michael on essayé de s'enfuir mais malheuresement ces derniers ce sont fait attrapés.

Lincoln est en liberté comparé à Michael qui est enfermé avec ses pires ennemis..

Il doit donc faire équipe avec Alex pour pouvoir sortir de cet ''enfer''  au plus vite.

Lincoln doit  annoncer à Michael que Sara et son fils ont été kidnappé  et qu'il devoit faire sortir une certaine personne de la prison de Suna pour pouvoir les revoirs.

Bien sûr, Sara est libre car Paul l'a disculper en arrivant comme témoin  au tribunal pendant l'audience. 

Michael se fait remarquer par le ''patron''  de la prison de Suna.